MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 19397 chromosome

Total Repeats: 23547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009697	TAA	2	6	1368	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009697	TTAT	2	8	1378	1385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009697	TTG	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009697	ATT	2	6	1464	1469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009697	TTA	2	6	1509	1514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009697	CAA	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009697	CTA	6	18	1530	1547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009697	TAT	2	6	1551	1556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009697	TCTATT	2	12	1561	1572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009697	TAA	2	6	1590	1595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009697	AGG	2	6	1596	1601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009697	TA	3	6	2944	2949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009697	AAT	2	6	2957	2962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009697	A	6	6	2970	2975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009697	TAT	2	6	2976	2981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009697	TAAT	2	8	2986	2993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009697	AGG	2	6	4391	4396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009697	ATA	2	6	8868	8873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009697	TTA	2	6	8903	8908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009697	A	6	6	8923	8928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009697	ATAA	2	8	8960	8967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009697	ATA	2	6	9030	9035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009697	AAC	2	6	9129	9134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009697	GGC	2	6	9312	9317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009697	CTTC	2	8	9349	9356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009697	GCG	2	6	9370	9375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009697	ATA	2	6	9448	9453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009697	GGTAA	2	10	9525	9534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009697	GCA	2	6	9622	9627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009697	GCA	2	6	9662	9667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009697	CGC	2	6	9669	9674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009697	TGA	2	6	9680	9685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009697	AGG	2	6	9738	9743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009697	CAG	2	6	9765	9770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009697	GAA	2	6	9957	9962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009697	GGC	2	6	9976	9981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009697	AGC	2	6	10185	10190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009697	GAA	2	6	10220	10225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009697	GGT	2	6	10293	10298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009697	GTC	2	6	10307	10312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009697	TCGTG	2	10	10316	10325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009697	TTA	2	6	10364	10369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009697	AGG	2	6	10417	10422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009697	ATC	2	6	10442	10447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009697	AC	3	6	10469	10474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009697	GGTA	2	8	10485	10492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009697	AC	3	6	10638	10643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009697	CCT	2	6	10779	10784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009697	AGAA	2	8	10798	10805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009697	TTCT	2	8	10811	10818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009697	GA	3	6	10845	10850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009697	TC	3	6	10855	10860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009697	GTTT	2	8	10880	10887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009697	GAA	2	6	11051	11056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009697	GGA	2	6	11214	11219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009697	AGAA	2	8	11222	11229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009697	GCG	2	6	11248	11253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009697	AGA	2	6	11314	11319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009697	ACC	2	6	11450	11455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009697	TAC	2	6	11469	11474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009697	GGA	2	6	11764	11769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009697	CGT	2	6	11877	11882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009697	TAG	2	6	11927	11932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009697	TAAGT	2	10	12053	12062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009697	AGC	2	6	12109	12114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009697	ACC	2	6	12188	12193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009697	AGGT	2	8	12652	12659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009697	GAG	2	6	12660	12665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009697	GAA	2	6	12684	12689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009697	CGG	2	6	12907	12912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009697	TGCT	2	8	13039	13046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009697	ACC	2	6	13178	13183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009697	CGG	2	6	13206	13211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009697	CCT	2	6	13266	13271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009697	CG	3	6	13319	13324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009697	GGT	2	6	13402	13407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009697	TCG	2	6	13517	13522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009697	CGT	2	6	13597	13602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009697	GAG	2	6	13646	13651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009697	GAA	2	6	13821	13826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009697	TAA	2	6	13883	13888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009697	GA	3	6	13928	13933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009697	A	6	6	13940	13945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009697	TTG	2	6	13946	13951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009697	A	6	6	13972	13977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009697	CCA	2	6	14193	14198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009697	CCA	2	6	14272	14277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009697	T	7	7	14316	14322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009697	A	6	6	14333	14338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009697	TAA	2	6	14358	14363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009697	ATT	2	6	14370	14375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009697	TAA	2	6	14390	14395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009697	TA	3	6	14401	14406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009697	GGT	2	6	14898	14903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009697	ATA	2	6	19288	19293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009697	T	6	6	19348	19353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009697	ATA	2	6	19378	19383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009697	TA	3	6	19388	19393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009697	AATT	2	8	19397	19404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009697	GA	3	6	20200	20205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009697	AGG	2	6	21621	21626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009697	TTA	2	6	22045	22050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009697	AG	3	6	22114	22119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009697	TAA	2	6	22138	22143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009697	AG	3	6	22209	22214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009697	T	7	7	22281	22287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009697	ATTAT	2	10	22288	22297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009697	TATT	2	8	22325	22332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009697	AATA	2	8	22342	22349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009697	ATT	2	6	23644	23649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009697	TA	4	8	23664	23671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009697	TTTAA	2	10	23672	23681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009697	ATTAA	2	10	23692	23701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009697	ATT	2	6	23705	23710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009697	TAT	2	6	23731	23736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009697	TAAA	2	8	23741	23748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009697	TATTT	2	10	23764	23773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009697	TAA	3	9	23784	23792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009697	AAT	2	6	23884	23889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009697	GA	3	6	23914	23919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009697	TC	3	6	23993	23998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009697	T	7	7	24140	24146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009697	A	7	7	24152	24158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009697	TTA	2	6	24183	24188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009697	AAT	2	6	24261	24266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009697	ATTT	2	8	24296	24303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009697	AGATTT	2	12	24311	24322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009697	TA	4	8	24329	24336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009697	AAT	2	6	24337	24342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009697	AT	3	6	24351	24356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009697	AT	3	6	24361	24366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009697	TTA	2	6	24385	24390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009697	A	7	7	24411	24417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009697	GA	3	6	24422	24427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009697	TC	3	6	24501	24506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009697	TA	3	6	24516	24521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009697	TAT	2	6	24654	24659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009697	AT	3	6	24694	24699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009697	ATAA	2	8	24783	24790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009697	T	8	8	24913	24920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009697	GAA	2	6	24921	24926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009697	TCC	2	6	24942	24947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_009697	TCA	2	6	24967	24972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009697	TAT	2	6	25008	25013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009697	CT	3	6	25086	25091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009697	ATT	2	6	25278	25283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009697	ATTTAG	2	12	25332	25343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009697	TAA	2	6	25383	25388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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